Un 7 de agosto de 1924, un grupo de jóvenes estudiantes de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos y de las Escuelas Especiales de Ingeniería y Agronomía crearon la Federación Universitaria de Fútbol.
Sin embargo, fue en 1931 cuando esta institución con un título en sus manos adopta el nombre Club Universitario de Deportes. Ese mismo año debuta a los 18 años, su máximo ídolo: Teodoro "Lolo" Fernández.
Durante su carrera de 23 años, "Lolo" solo vistió la camiseta de Universitario, asimismo fue seis veces campeón con el club , en siete ocasiones goleador del torneo y máximo anotador en la historia de los clásicos con 29 goles.
Héctor Chumpitaz, Alberto Terry, Roberto Challe, José Luis Carranza, Roberto Martínez y Jorge Amado Nunes, son algunas de sus máximas estrellas.
Hasta la fecha es el equipo que más campeonatos nacionales ha obtenido, ostentando veintiséis títulos (siete en la era amateur y diecinueve en la era profesional).
